Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TnikP83510 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TnikP83510 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TnikP83510 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TnikP83510 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TnikP83510 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TnikP83510 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TnikP83510 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TnikP83510 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TnikP83510 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TnikP83510 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms