Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcr4P70658 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcr4P70658 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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