Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tp53bp1P70399 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tp53bp1P70399 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms