Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rad50P70388 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rad50P70388 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms