Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgf11P70378 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms