Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gfi1P70338 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms