Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sycp3P70281 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sycp3P70281 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms