Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vamp7P70280 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp7P70280 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms