Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Chl1P70232 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Chl1P70232 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms