Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf5P70191 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf5P70191 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms