Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rab3cP62823 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rab3cP62823 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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