Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tbpl1P62340 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbpl1P62340 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms