Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rps29P62274 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Rps29P62274 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms