Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vbp1P61759 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Vbp1P61759 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Vbp1P61759 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vbp1P61759 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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