Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Depdc5P61460 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Depdc5P61460 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms