Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Psme3P61290 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Psme3P61290 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme3P61290 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme3P61290 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Psme3P61290 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms