Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rin3P59729 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rin3P59729 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rin3P59729 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rin3P59729 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms