Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hps5P59438 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hps5P59438 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms