Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubgcp3P58854 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms