Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smpdl3bP58242 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms