Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf2P58021 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms