Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcbp4P57724 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pcbp4P57724 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp4P57724 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcbp4P57724 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms