Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp25P57080 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Usp25P57080 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp25P57080 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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