Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp5bP56480 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp5bP56480 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms