Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gp1bbP56400 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gp1bbP56400 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms