Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkn2bP55271 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdkn2bP55271 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms