Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pex2P55098 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms