Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RabggtbP53612 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RabggtbP53612 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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