Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux1P53564 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cux1P53564 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cux1P53564 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms