Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Map3k1P53349 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Map3k1P53349 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms