Protein–RNA interactions for Protein: P52946

Pdx1, Pancreas/duodenum homeobox protein 1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdx1P52946 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pdx1P52946 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdx1P52946 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdx1P52946 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdx1P52946 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdx1P52946 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdx1P52946 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms