Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox5P52651 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox5P52651 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms