Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upp1P52624 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upp1P52624 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms