Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec1P51908 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec1P51908 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms