Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FmodP50608 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FmodP50608 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FmodP50608 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms