Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TubP50586 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TubP50586 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TubP50586 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TubP50586 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TubP50586 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TubP50586 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TubP50586 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TubP50586 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TubP50586 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TubP50586 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TubP50586 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TubP50586 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms