Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrprbP47758 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms