Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf9P41274 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tnfsf9P41274 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tnfsf9P41274 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfsf9P41274 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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