Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LtbP41155 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LtbP41155 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LtbP41155 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LtbP41155 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LtbP41155 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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