Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TfamP40630 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TfamP40630 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TfamP40630 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms