Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VhlP40338 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VhlP40338 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms