Protein–RNA interactions for Protein: P39039

Mbl1, Mannose-binding protein A, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl1P39039 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms