Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn1P35821 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn1P35821 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms