Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddit3P35639 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms