Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms