Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ly6dP35459 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms