Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms