Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp13P33435 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp13P33435 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms