Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc11P31313 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms