Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ctnnd1P30999 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms